--- title: "For utviklere av Rapporteket" output: rmarkdown::html_vignette vignette: > %\VignetteIndexEntry{For utviklere av Rapporteket} %\VignetteEngine{knitr::rmarkdown} %\VignetteEncoding{UTF-8} --- ```{r, include = FALSE} knitr::opts_chunk$set( collapse = TRUE, comment = "#>" ) ``` Rapporteket er en Shiny-app utviklet i R. Dette betyr at det meste av funksjonaliteter som trengs for å utvikle applikasjonene er generelle funksjoner som er tilgjengelige i R-universet. Det er likevel noen spesielle ting som gjør Shiny-applikasjonen til en Rapporteket-applikasjon. Dette er: - **rapbase-funksjoner:** Rapbase er en pakke som tilbyr en rekke spesialiserte Rapporteket-funksjoner. Det er Nasjonalt Servicemiljø som vedlikeholder denne pakken, men vi ønsker velkomne forslag og tillegg her. Vi jobber med å dokumentere funksjonene så godt det lar seg gjøre. De essensielle funksjonene som må brukes er: - `navbarWidgetServer2`/`navbarWidgetInput` for å hente ut brukernavn, rolle og tilhørighet som kommer fra FALK. - `repLogger`/`appLogger` for å logge til Rapporteket sine logg-databaser. - `loadRegData` for å kjøre spørringer mot database. - `autoReportServer`/`autoReportInput`/`autoReportUI` for å sette opp autorapport-utsending. - `loggerSetup` for å få ut logg i `json`-format. - **Miljøvariabler:** På Norsk Helsenett lagres informasjon om brukeren og Rapporteket kan tilpasses denne brukeren slik at data blir tilgjengelig basert på brukerens tilhørighet eller rolle i registeret. I tillegg er det viktig å logge hvem som ser dataene. For å kjøre applikasjonen lokalt må nødvendige miljøvariabler defineres. Dette kan enten defineres i `.Renviron`, i `.Rprofile` ved hjelp av `Sys.setenv()`, i `docker-compose.yml`-fil eller i egen R-fil som *sources* før kjøring av applikasjon. Miljøvariabler som er essensielle er: - `FALK_EXTENDED_USER_RIGHTS` - `FALK_APP_ID` - `MYSQL_DB_LOG` - `MYSQL_DB_AUTOREPORT` - `MYSQL_DB_DATA` - `MYSQL_HOST` - `MYSQL_USER` - `MYSQL_PASSWORD` - `USERORGID` - `SHINYPROXY_USERNAME` - `SHINYPROXY_USERGROUPS` - `SHINYPROXY_APPID` - `R_RAP_INSTANCE` - `R_RAP_CONFIG_PATH` - **Docker Container:** Applikasjonen skal kjøres i en Docker Container på Norsk Helsenett. Ved publisering av ny versjon av en Rapporteket-applikasjon bygges et *image* på github gjennom en github-action. Dette image dyttes så opp til NHN. For utviklere som har slik software tilgjengelig kan det være lurt å kjøre applikasjonen lokalt også i en container for å få testet applikasjonen i et så likt miljø som mulig. - **Databaser:** Rapporteket-applikasjonen er avhengig av at det finnes databaser for logging og abonnement. Kode for å lage disse ligger i pakken *rapbase* og må kjøres mot en databaseserver som utvikleren har tilgang til. I tillegg skal applikasjonen ha tilgang til database som inneholder registerdata. Det finnes funksjonalitet i *rapbase* for å hente ned databasedump fra NHN for å kunne teste lokalt. - **R-pakke:** Erfaring tilsier at det er enklest og best å utvikle applikasjonen som en R-pakke. Dette er fordi det gir god struktur på koden og gjør det enklere å vedlikeholde applikasjonen over tid. Det vil si at utvikleren utvikler applikasjonen etter retningslinjene for pakke-bygging i R. ## Dette trenger du for å utvikle Rapportek: For å kunne utvikle Rapportek-applikasjon trenger man - R og RStudio installert - kjennskap til R og Shiny - Git installert - et *repository* på [github.com/Rapporteket](https://github.com/Rapporteket/) (dette lages av SKDE) - kjennskap til git og GitHub - databaseinnstallasjon (MySQL/MariaDB) - LaTeX installert I tillegg er det nyttig med docker installert for å kunne teste applikasjonen i et så likt miljø som mulig som det den skal kjøres på NHN.